Písmo, které staří Harappané používali, zůstává nevyřešenou záhadou. Přes desítky pokusů předních vědců se jej doposud nepodařilo rozluštit. Selhalo srovnání s egyptskými, minojskými či chetitskými hieroglyfy i dalšími druhy starověkých písem. Nápisy v neznámém jazyce na nalezených pečetidlech zpravidla nepřesahují délku dvaceti znaků. S jistotou lze pouze říct, že podle nejnovějších soupisů čítá harappské písmo 398 znaků, že se psalo zprava doleva a že některé znaky znázorňují slabiky a jiné celá slova.
